标志由字母“S”衍生，S 既代表科青联的行政属性和地理位置——四川（Sichuan），又代表科学（Science）。
  主形态既是两个四川的“川”字的旋转和变化，也是两个字母 “Y”（Youth，青年）的变体；其呈现的正负形态，象征着科技，即科学和技术，二者相辅相成、阴阳相生的关系。
  “川”或“Y”形成两只手的合抱形态，寓意联合，既体现了科青联的组织结构——四川省青年科技工作者联合在一起，交流协作、团结共生，又体现了科技的内涵——科学和技术相互融合、相互支撑。“川”或“Y”还形似飘带，象征了科青联传播科技文化的社会功能。